Apulaisjohtaja Walter Sergei Skinner liittyi USA:n merivoimiin vuonna 1968. Hän palveli taistelutehtävissä Vietnamissa. Hänelle myönnettiin purppuraristi sen jälkeen kun hänet noudettiin ainoana eloonjääneenä vihollisen väijytyksestä. Asepalveluksensa jälkeen Skinner liittyi FBI:hin. Hän nousi nopeasti arvoasemassa ja hänestä tuli aluetoimiston johtava erikoisagentti ennen kuin sai siirron FBI:n päämajaan Washingtoniin. Tästä seurasi nopeita ylennyksiä joiden tuloksena Skinneristä tuli apulaisjohtaja. Agentit Mulder ja Scully olivat ehtineet olla yli vuoden yhdessä X-arkistoissa ennen kuin Skinner sai valvottavakseen heidän toimintansa. Vaikka hän on osoittautunut tiukaksi esimieheksi, on hän myös osoittanut myötätuntoa alaisiaan kohtaan. Tarvittaessa hän on puolustanut Mulderia ja Scullya sanoin ja teoin. Tämä ei ole ainoastaan tuonut Skinneriin kohdistunutta kiristystä ja yrityksiä pilata hänen maineensa, mutta myös yrityksiä surmata hänet. Vuoden 1999 alkupuolella Alex Krycek istutti Skinnerin ruumiiseen nanoteknologialla tuotettuja pieniä robotteja, joita voidaan käyttää korjaukseen kuin myös vahingoittamiseen. Skinner on kuoleman kielissä kunnes Krycek antoi hänen ruumiinsa toipua. Tämän tarkoituksena oli saada Skinner lojaaliksi Krycekille ja häntä edustaville tahoille. Keväällä 2000 Skinner todisti Mulderin sieppausta. Hän näki avaruusaluksen eikä voinut kieltää sitä itseltään. Skinneristä tuli uskoja ja hän auttoi Scullya ja Doggettia parhaansa mukaan Mulderin etsinnöissä. Kun Mulder lopulta löytyi, oli täysin Skinnerin ansiota että hän vielä tänä päivänä on hengissä. Scullyn raskauden aikaan Skinner kosti Krycekille silmä silmästä. Hän ampui tämän FBI:n parkkihalliin. Syytteitä ei nostettu sillä todisteet hävitettiin 48 tunnin kuluessa tuntemattoman tahon johdosta. Nykyään Skinner on pahassa välissä FBI:ssa, sillä hän yrittää taistella salaliittoa vastaan, joka virtaa pitkällä FBI:n johtoportaassa. Tiukasti keskittyen hänen asemansa tuomiin velvollisuuksiin, Skinner on pystynyt pitämään hänen henkilökohtaisen elämän yksityisenä ja visusti erollaan työelämästä. Hänen avioliittonsa Sharon Skinnerin kanssa pysyi tuntemattomana Mulderille ja Scullylle toiseen vuoteen saakka minä aikana Skinner on ollut heidän valvojansa. Apulaisjohtaja Skinner harrastaa golfia sekä hölkkäystä virkistäytyäkseen ja pysyäkseen kunnossa.
Walter Skinner on esiintynyt seuraavissa jaksoissa:
|